عفونتهاي قارچي مجاري تنفسي از علل مهم ابتلاء و مرگ و مير در بيماران ايمونوكامپرومايزد است. در اين دسته از بيماران افرادي وجود دارند كه بعلت ابتلاء به بيماريهاي نئوپلاستيك تحت شيميدرماني سيتوتوكسيك قرار ميگيرند و يا افراد ديگري كه در آنها پيوند سلولهاي بنيادي مغز استخوان انجام گرفته است و يا برخي ديگر كه پيوند عضو گرفته و بالاخره افرادي كه به سندرم ايدز دچار شدهاند. نكته قابل توجه اين است كه به موازات جمعيت رو به افزايش گروههاي فوقالذكر موارد فزايندهاي از آسپرجيلوزيس مهاجم گزارش ميشوند. همچنين ساير قارچهاي رشتهاي نظير فوزاريوم، زيگوميستها و سودوآلشريا بويدياي نيز گزارشهاي رو به فزوني را بويژه در بيماراني كه داراي نقائص كمي يا كيفي در عملكرد نوتروفيلهايشان هستند به خود اختصاص دادهاند. ميكوزهاي اندميك از قبيل هيستوپلاسما كپسولاتوم واريته كپسولاتوم، كوكسيديوئيدس ايميتيس و پنيسيليوم مارنفئي نيز در ميزبانان ايمونوكامپرومايزد و در نواحي جغرافيائي مورد انتظار در حال افزايش ميباشند.